A história gira em torno de um Naruto Uzumaki mais velho e um pouco mais amadurecido, e sua busca para salvar seu amigo Sasuke Uchiha das garras do Shinobi Orochimaru. Depois de 2 anos e meio Naruto finalmente retorna à sua aldeia de Konoha, e decide colocar suas ambições em ação, mas não será fácil.