Na Bíblia Galáctica, existe uma profecia sobre um guerreiro celestial com o poder de derrotar o universo das forças do mal. Quando o profeta Edin (Noboru Nakaya) encontra um garoto humano que sobreviveu a um acidente que matou seus pais, ele acredita que o jovem é a pessoa que vai se tornar esta figura lendária e cria o menino. Já adolescente, Jaspion (Hikaru Kurosaki) descobre seu destino e o aceita. Com a ajuda de Anri (Kiyomi Tsukada), uma androide construída por Edin, sua missão é é encontrar os pedaços da Bíblia Galáctica e destruir o cruel Satan Goss, nascido partir da união de todas as energias negativas do universo.