Em um futuro próximo, novas tecnologias foram desenvolvidas. Nas redes sociais, rumores têm circulado sobre fenômenos estranhos de autenticidade desconhecida, conhecidos como 'fantasmas de holograma'. O estudante do primeiro ano do ensino médio, Hiro Amanokawa, ativa um misterioso dispositivo deixado por seu pai chamado 'Digivice', resultando em criaturas desconhecidas que não podem ser vistas por uma pessoa comum - Digimon - tornando-se visíveis para ele. Desde o dia em que conheceu Gammamon, um Digimon travesso que foi confiado a ele por seu pai, Hiro foi pego em vários fenômenos estranhos. Fantasmas do holograma estão por perto e estão nos atacando. Daqui em diante, essa é uma história sobre o outro lado do mundo que ninguém sabe. Junto com Gammamon e seus amigos, Hiro põe os pés em um mundo misterioso habitado por Digimon.