A história é a de Ryou Murasame, um jovem que durante uma viajem a amazônia com sua irmã, tiveram seu avião derrubado por uma organização terrorista conhecida como o Império Badan. Os irmãos foram capturados, e Badan mata a irmã de Murasame, que em seguida é transformado em um ciborgue guerreiro chamado ZX. Ryou também sofre uma lavagem cerebral, no entanto, um acidente permite que ele recupere sua memória. Para vingar sua irmã, Kamen Rider ZX luta ao lado dos outros nove Riders, que lhe ajudam a derrotar o Império Badan.