Apesar da derrota de Quinella – o pontífice da Igreja Axioma – as coisas ainda não parecem ter se acalmado. Ao entrar em contato com o mundo real, Kazuto Kirito Kirigaya descobre que a Ocean Turtle - um mega-flutuador controlado por Rath - foi invadida. Devido a um curto-circuito repentino causado pelos invasores, a lanterna flutuante de Kirito foi danificada, deixando-o em coma. Sentindo-se insegura com as pessoas da Igreja Axiom, Alice traz o inconsciente Kirito de volta para sua cidade natal - Rulid Village, desconsiderando seu banimento devido a um crime não resolvido. Agora, Alice está vivendo uma vida comum e pacífica perto da vila, desejando que Kirito acorde.